Das Fauna-Flora-Habitat-Gebiet im Atteltal würde durch die stellenweise Auflösung des Bestands und die anschließende Umverlegung wieder zusammengeführt werden. Limone durchtrennt hingegen ebenso schützenswerte Felder, Wiesen und Wälder und (zer-)stört insgesamt 300 ha Freizeit- und Erholungsgebiet. Im Gegensatz dazu wird bei Türkis eine 0,06 ha große Fläche bei Oberelkofen und eine damit zusammenhängende Wegverlegung um ca. 4 m als Rechtfertigung verwendet, um Türkis im Trassenauswahlverfahren nur 3 von 5 Punkten zu geben, während alle anderen Trassen mit 4 Punkten besser abschneiden.

Darüber hinaus verbraucht die Trasse Türkis temporär 5,9 ha und dauerhaft 4,5 ha weniger als Limone. Auch das wurde im Trassenauswahlverfahren falsch bewertet, da die DB bei ihrer Berechnung eine andere Methode verwendet hat als die, die ursprünglich von ihr selbst als korrekt festgestellt worden war und die einem wissenschaftlichen Vorgehen entspräche.